南京醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科是集醫(yī)療、教學(xué)、科研為一體的腦血管疾病及神經(jīng)系統(tǒng)各疾病診療中心；現(xiàn)為江蘇省省級(jí)臨床重點(diǎn)專科，南京市市級(jí)臨床重點(diǎn)專科，江蘇省區(qū)域卒中救治中心；南京醫(yī)科大學(xué)神經(jīng)病學(xué)碩士研究生培養(yǎng)點(diǎn)，國(guó)家藥物臨床試驗(yàn)驗(yàn)證機(jī)構(gòu)。在崗醫(yī)生24人，主任醫(yī)師6人，副主任醫(yī)師7人。

神經(jīng)內(nèi)科常規(guī)開展設(shè)腦血管病、神經(jīng)變性病、記憶障礙、睡眠障礙、頭暈和眩暈等專病門診。三院區(qū)秉承“病人不動(dòng)醫(yī)護(hù)動(dòng)”的原則，常規(guī)開展時(shí)間窗內(nèi)動(dòng)靜脈溶栓、血管內(nèi)介入取栓、腦血管造影和顱內(nèi)外動(dòng)脈支架植入術(shù)、動(dòng)脈瘤介入栓塞、動(dòng)脈瘤夾閉術(shù)、頸動(dòng)脈內(nèi)膜剝脫、顱內(nèi)動(dòng)靜脈畸形等血管內(nèi)治療技術(shù)。于2018年12月成立腦卒中專病聯(lián)盟，目前有聯(lián)盟單位近20家，名醫(yī)工作室4家。